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特种动物养殖专业毕业生主要在动物养殖企业、自然保护区、动物园、野生动物保护部门、动物产品加工、流通、服务企业、饲料生产企业，动检、商检、科技推广等部门。

特种动物养殖专业毕业生可从事畜牧兽医部门的行政管理、高等院校教学、科学研究，各级进出境动物检疫部门、畜产品出口部门、食品进出口部门、食品卫生检疫部门、动物及动物制品检验、卫生医药、药检、药政等部门的科技工作，畜禽及宠物疾病诊疗工作和动物生物制品厂与兽药厂的管理、生产和营销工作，动物园、宠物饲养场等场所的医疗保健工作。